환경보건시스템학과는 인간과 자연환경과의 조화 및 인간의 건강을 중시하는 미래지향적 환경보건학을 연구함으로써 미래사회가 요구하는 이론과 실무를 겸비한 새로운 개념의 환경보건관리 전문가 양성을 핵심적인 목표로 삼고 있다. 이를 위하여 물, 공기, 지하수 등 다양한 매체에서의 환경관리, 폐기물 자원화, 환경 및 직업적 위해요인에 대한 노출과 건강위해성 평가, 환경보건 사례연구 등 통합적 환경보건시스템 분야의 교과를 운영한다. 이과 같은 교육방법을 통해 궁극적으로 환경 보존 및 건강 위험성 예방에 기여하고자 한다.